Di Pondok Pesantren Nurul Fattah pendidikan santri berlangsung selama 24 jam di dalam lingkungan yang telah didesign untuk menunjang tercapainya tujuan pendidikan yang terintregrasi dan berkualitas dengan memadukan kegiatan sekolah/umum, pondok dan extrakulikuler dalam satu kesatuan sistem pendidikan. Dan mengunggulkan kegiatan bercakap-cakap menggunakan bahasa asing yaitu bahasa Arab dan Inggris yang dipraktekkan dalam keseharian santri mulai dari bangun tidur hingga tidur kembali.

Adapun Jenjang Pendidikan yang ada di Pondok Pesantren Nurul Fattah Yaitu :